Tôn Nghiệp Lễ sinh vào ngày 9 tháng 12 năm 1964 tại huyện An Khâu, nay là thành phố cấp huyện thuộc địa cấp thị Duy Phường, tỉnh Sơn Đông, Cộng hòa Nhân dân Trung Hoa.[1] Ông lớn lên và tốt nghiệp cao trung ở An Khâu, thi cao khảo và đỗ Đại học Bắc Kinh vào năm 1981, nhập học hệ lịch sử học và tốt nghiệp Cử nhân Lịch sử vào năm 1985. Sau đó, ông thi đỗ chương trình nghiên cứu sinh thạc sĩ ngành lịch sử của Bắc Đại, bảo vệ thành công luận văn thạc sĩ đề tài "Kinh nghiệm Diên An và sự phát triển của sản xuất nông nghiệp Trung Quốc trong những năm 1950", nhận bằng Thạc sĩ Lịch sử học năm 1988.[2] Ông được kết nạp Đảng Cộng sản Trung Quốc tại Bắc Đại trong những năm học này.[3]